内河港口内贸吞吐量1990年至1995年年均增长5.5％，1995年至2000年出现负增长(－0.56％)。进入新世纪，内河内贸吞吐量明显加快， 2000年至2004年年均增长15.1％，2000年至2004年5年净增长9.3亿吨，相当于历史增量的总和。
2000年至2004年，全国经贸出现加快发展态势，重化工工业的加速推进，投资率的不断提高，使运输需求快速增长，特别是长江三角洲、珠江三角洲的土地价值和环境价值不断提高，人均GDP水平相继进入内河优势发挥临界区，内河运输运能大、占地省的比较优势不断显现，运量增长速度一直保持在全国平均水平以上，2004年更是高出全国平均速度13个百分点以上，内河运量占全国运量的比重在2005年上升到5.68％。内河在综合运输体系中的地位有所提高，优势开始在中国具有水运资源、经济相对发达的地区得到显现。
